由于餐厨垃圾含水率高，易腐烂一般来说，餐厨垃圾应该日产日清，但是因为工艺等问题的限制，很多时候需要对垃圾进行预处理。因此，在对餐厨垃圾进行处理处置之前，必须要考虑到收集、除臭、运输和存储等问题。
  餐厨垃圾的收集问题
  无论是堆肥、厌氧消化加工制饲料还是制取生物柴油为了提高处理效果以及产品的质量，都必须保证进料的纯度尽可能减少异物含量，因此，在加快实施分类收集进程的同时，必须着重提高分类收集的质量。例如：发酵工艺是对进料纯度要求比较高的一种工艺，餐厨垃圾本身含有大量的脂类物质，若不进行油水分离，过多的油脂会导致过度酸化，影响厌氧发酵反应的进行。
   1.恶臭防治技术
 餐厨垃圾处理处理前，氨基酸等有机物容易发臭，如何高效经济解决餐厨垃圾的恶臭问题有待进一步研究。代表目前最先进的脱臭方法的是生物除臭技术。生物除臭一般有两种途径：一是在没有腐化发臭的垃圾中加入微生物菌种，使之达到减容和消除臭味的目的：二是在已经腐化产生恶臭的垃圾中加入微生物菌群，控制恶臭的产生，并消除已经产生的恶臭，目前国内对于除臭研究的重点集中在除臭菌剂的研制上，已经开发除了多种生物除臭剂来处理大型生活垃圾中转站中的恶臭。餐厨垃圾微生物菌群除奥剂的发展方向是制备固定化微生物提高对恶臭的去除率；筛选出存活容易、适应性强及遗传性稳定的优势菌株：将除臭剂制剂化、商品化。
 2.运输、存储及处理设备研发
  由于餐厨垃圾的高含水性，目前普通的运输车辆都不适合餐厨垃圾的运输，主要问题是密闭性差装卸难度大，同时，对于餐厨垃圾的存储设备要求也比较高普通的容器很难使餐厨垃圾从容器中清理出来因此应该设计专用的容器，使之具备密闭性好，清洗简单不生锈、耐用等特点。再则，餐厨垃圾的脱水设备一般采用离心机脱水，但是普通的离心机清洗难度大，易生锈。有些离心机采用塑料容器，但易老化，清洗也很困难。
  餐厨垃圾的收集和处理问题刚刚提出来不久目前市场上还缺少包括预处理设备在内的一系列成熟的设备。目前出现了一种餐厨垃圾处理设备，它通过控制温度通风量和搅拌速度将餐厨垃圾在短时间内发酵，烘干(餐厨垃圾干燥设备)再加工为饲料或肥料，这种餐厨垃圾处理设备时间短，工艺简单，设备小，适用面广，已经运用于学校食堂，宾馆等餐厨垃圾产量集中，品质稳定的单位。但是这种设备没有相应的预处理设备进料含水量大，导致要消耗大量电能来降低其含水率；同时由于进料未经分选成分复杂，产品品质不稳定。随着技术的改进，餐厨垃圾处理设备具有广泛的市场前景。