餐厨垃圾补贴主要分为收运补贴和处理补贴，政府仅支付企业承担部分的资金补贴。例如，2013年北京石景山餐厨垃圾资源化处理项目中，企业只负责处理，处理补贴为185元/t。湖南长沙餐厨垃圾资源化处理项目中，企业只负责收运，相应收运补贴为125元/t。
发展过程。我国早期对餐厨垃圾处理市场认识不足，补贴费用大多偏低。随着近些年餐厨垃圾项目越来越多，补贴价格的制定也日趋合理。如重庆餐厨垃圾处理项目一期处理补贴仅为108元/t，后启动的二、三期处理补贴提高到约130元/t。
地域差异。由于不同地区经济发达程度和餐厨垃圾成分不同，政府对项目给予的补贴价格也会存在一定差异。例如，2013年山东省启动的餐厨垃圾处理项目的处理补贴平均价格约120元/t。按照业内收运补贴费100元/t计，相当于收运处理补贴总价格为220元/t。江苏省近年来对餐厨垃圾项目非常支持，补贴价格位于国内中上水平，如2013年签订的常州餐厨垃圾项目，其收运和处理补贴价格为239.5元/t。
处理量。同一条生产线处理200t和处理20t餐厨垃圾所需开机时间和运行成本相差无几，但产出量悬殊较大。开机次数越多，亏损越多。因此，项目处理量越大其单位补贴成本越低。根据统计分析，目前餐厨垃圾项目处理量平均约200t/d。因此，可以考虑增加低于平均处理量项目的补贴价格。
地沟油产量。地沟油处理是餐厨垃圾项目中的重要赢利点，企业收运地沟油后进行正规处理可加工成生物柴油或更高级的产品，如环氧甲酯等。生物柴油售价约3000元/t，而处理成本不足120元/t。因此，政府若能保证企业收运更多的地沟油，将对企业运营具有积极意义，相应补贴价格也可以适当降低。
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